本文主要向大家介绍了Linux运维知识之Linux安装HDF5及遇到的问题总结，通过具体的内容向大家展现，希望对大家学习Linux运维知识有所帮助。

ubuntu版本：16.04.2 64位
从HDF官网（https://support.hdfgroup.org/HDF5/）上下载hdf5-1.8.17.tar.gz

 
简要安装步骤如下：（详细步骤：hdf5-1.8.17/release_docs/INSTALL）
$ gunzip < hdf5-X.Y.Z.tar.gz | tar xf -   #解压缩
$ cd hdf5-X.Y.Z
$ ./configure --prefix=/usr/local/hdf5  #安装路径
$ make
$ make check                # run test suite.
$ make install
$ make check-install        # verify installation.
注：X.Y.Z是HDF版本
 
安装成功后，在安装目录/usr/local下出现hdf5文件夹，打开后

在/share/hdf5_examples/下是示例程序。打开c文件夹，下面我们来测试。该文件夹下有个名为run-c-ex.sh文件，执行该文件可以将c目录下所有.c文件执行。

运行命令：$ sudo ./run-c-ex.sh
即可得到所有文件的执行结果。
 
打开run-c-ex.sh文件可查看该文件内容如下

 
下面我们来讲怎么执行单个.c文件，以/usr/local/hdf5/share/hdf5_examples/c目录下h5_extend.c为例
执行 $ sudo h5cc -o h5_extend h5_extend.c

可是却报出错误：h5cc:command not found
我们在命令行输入h5cc，可以看到

提示我们h5cc没有安装，按照指示，我们输入sudo apt install hdf5-helpers

接下来再执行，却报出hdf5.h: No such file or directory的错误

只要安装libhdf5-serial-dev就可以了。
执行命令：$ sudo apt-get install libhdf5-serial-dev

再次执行 $ sudo h5cc -o h5_extend h5_extend.c
没有问题，执行：$ ./h5_extend

在/share/hdf5_examples/c目录下除了生成h5_extend和h5_extend.o两个文件，还有extend.h5文件。


 
下面介绍一个可视化工具HDFView，它可以用来查看和编辑HDF文件。（https://support.hdfgroup.org/products/Java/hdfview/）
下载HDFView，即可查看我们刚刚得到的extend.h5

本文由职坐标整理并发布，希望对同学们有所帮助。了解更多详情请关注系统运维Linux频道！